Каков Олигонуклеотид?
Олигонуклеотид - короткая цепь ДНК или молекул РНК, у которого есть много использования в молекулярной биологии и медицине. Это используется в качестве исследования к ситу для болезней, вирусных инфекций, и идентифицировать гены в экспериментах молекулярной биологии. Это также используется в качестве праймера в типе секвенирования ДНК.
Чтобы понять олигонуклеотид, это помогает понять структуру ДНК. Молекулы ДНК - очень длинные катушки двух проволоки, сделанной из четырех различных мономерных звеньев макромолекулы нуклеотида, устроенных в изменении заказов. У каждой единицы есть дополнительная основа, которую она свяжет, таким образом, у каждой проволоки будет противоположный набор оснований, связывающих ее. Эти основания могут формировать большую разновидность различных комбинаций, и это - комбинация оснований, которая дает генетический код. ДНК расшифрована, чтобы произвести РНК посредника (mRNA), который тогда переведен, чтобы произвести белки.
Олигонуклеотиды идентифицированы их длиной цепи. Например, олигонуклеотид, который является десятью основаниями нуклеотида долго, называли бы <они> десятью мерами . Они вообще синтезируются химически, и тип синтеза ограничивает длину цепи меньше чем 60 основаниями долго.
В типе секвенирования ДНК, известного как <они> dideoxy секвенирование , олигонуклеотиды используются в качестве праймера, так, чтобы у фермента, который делает ДНК, была матрица, чтобы работать от. Одноцепочечная ДНК используется, и олигонуклеотид, который дополнителен к нити ДНК, синтезируется, используя автоматизированный механизм. Полимераза ДНК, которая синтезирует ДНК, продолжает добавлять на праймер, и синтезирует противоположную проволоку ДНК от нее. Эта реакция производит двухспиральную ДНК.
Более свежее использование олигонуклеотидов как праймеры находится в цепной реакции полимеразы (PCR), который используется, чтобы усилить малые фрагменты ДНК. У этой методики есть очень практические применения, такой как в тестировании отцовства и судебной экспертизе. Это также реконструировало исследование в медицине и биологических науках, так как это часто используется в экспериментах генной инженерии.
Ряд исследований олигонуклеотида часто используется, чтобы изолировать гены от библиотеки генов или дополнительных ДНК (КОМПЛЕМЕНТАРНЫЕ ДНК). библиотеки КОМПЛЕМЕНТАРНОЙ ДНК состоят из двухспиральной ДНК, в которой проволока получена из проволоки mRNA, и другой дополнительно к этому. У таких библиотек есть преимущество, что у них нет промежутков, которые часто находятся в генах от более высоких организмов.
Структура генов от многих организмов известна, из-за проектов секвенирования, и публично доступна. Если Вы хотите имитировать ген от другого организма, можно видеть то, что известно о гене в других организмах, и исследованиях дизайна, основанных на общих зонах в тех последовательностях. У исследователей тогда есть ряд исследований олигонуклеотида, синтезируемых, которые принимают во внимание возможные изменения в общей зоне. Они сито, библиотека с теми исследованиями и ищет олигонуклеотиды, которые затвердевают. Много генов были идентифицированы в этой манере.
Олигонуклеотид антисмысла содержит одиночную нить РНК или ДНК, которая является дополнением последовательности интереса. Как только специфическое генное кодирование для белка имитировалось, РНК антисмысла часто используется, чтобы заблокировать ее отжимание, затвердевая к mRNA, который синтезировал бы это. Это позволяет исследователям определять эффекты на организм, когда он не делает тот белок. Олигонуклеотиды антисмысла также разрабатываются как новые типы наркотиков, чтобы заблокировать токсические РНК.
чипс Микромножества был другой областью, в которой олигонуклеотиды имели большую полезность. Они - стеклянные скольжения, или некоторая другая матрица, у которых есть пятна, содержащие тысячи различных ДНК-зондов — в этом случае сделанный из олигонуклеотидов. Они - очень эффективный способ проверить на изменения во многих различных генах сразу. ДНК связана к составу, который изменяет цвет, или флуоресцирует, если дополнительная ДНК затвердевает к этому, таким образом, цвет изменения пятен, если есть реакция с испытательной ДНК.
Некоторые из вещей, для которых используются микромножества олигонуклеотида, включают просеивание для генетических заболеваний. Например, есть малые исследования, которые представляют деятельность генов, включаемых в раке молочной железы, BRCA1 и BRCA2 . Возможно узнать, есть ли у женщины мутация в одном из этих генов, и проанализируйте это далее, чтобы видеть, есть ли у нее склонность к раку молочной железы.
Есть микромножество, названное <ими> ViroChip , у которого есть исследования приблизительно для 20 000 генов от различных патогенных вирусов, которые были упорядочены. Секреции тела, такие как мокрота, могут быть проанализированы с крошкой, которая может часто идентифицировать, каким вирусом человек заражен. Идентификация вирусных инфекций может быть довольно трудной, так как признаки часто подобны с различными типами вирусов.